基本信息

名称：国家动物标本资源库馆藏勺鸡标本基因组重测序数据集

标识符：CSTR:19715.10.2.AVES.Molecular.00001

作者：中国科学院动物研究所国家动物标本资源库

发布日期：2025-04-03

介绍页面链接：http://museum.ioz.ac.cn/topic_detail.aspx?id=72608.

引用格式：

中文：中国科学院动物研究所国家动物标本资源库. 国家动物标本资源库馆藏勺鸡标本基因组重测序数据集. 2025. CSTR:19715.10.2.AVES.Molecular.00001.

http://museum.ioz.ac.cn/topic_detail.aspx?id=72608.

英文：National Animal Collection Resource Center, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences. Dataset of Genomic Resequencing of Pucrasia macrolopha specimens in National Animal Collection Resource Center. 2025. CSTR:19715.10.2.AVES.Molecular.00001.

http://museum.ioz.ac.cn/topic_detail.aspx?id=72608.

发布/更新情况：

数据信息

数据集负责人及联系方式：
贺鹏（中国科学院动物研究所），hepeng@ioz.ac.cn；

姜志永（安徽师范大学生态与环境学院），zhiyongjiang@ahnu.edu.cn

数据采集人及单位：
姜志永，安徽师范大学生态与环境学院

实物标本保藏单位：中国科学院动物研究所国家动物标本资源库

实物标本采集人：国家动物标本资源库

时间范围：不限

空间范围：不限

关键词：勺鸡; 基因组

学科类别：180.57 动物学

涉及生物类群：脊索动物门鸟纲鸡形目雉科勺鸡（Pucrasia macrolopha）

主题分类：鸟类分子

数据类型：基因组重测序数据

文件格式：.fastq

涉及标本数量：28号

数据大小：534G

包含字段（内容）：每个个体的重测序数据

数据采集方式：基于古DNA的提取方式，使用Qiagen的QIAamp DNA Micro Kit的操作步骤，其中使用双倍的蛋白酶K和buffers ATL，消化过夜，并且提取DNA。使用NEBNext Ultra DNA Library Prep Kit构建文库，在DNBSEQ-T7RS测序仪上完成测序。

资助情况：标本的管理和数字化获得了国家动物标本资源库（National Animal Collection Resource Center, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences）和中国科学院战略生物资源计划（Biological Resources Programme，Chinese Academy of Sciences，BRP CAS）的资助；基因组重测序数据的获取得到了安徽省青年基金（编号：2408085QC087）的资助。

应用方向举例：本数据集可用于探究勺鸡的遗传分化。

数据集摘要

对国家动物标本资源库馆藏勺鸡（Pucrasia macrolopha）28号标本的趾垫样品进行了基因组重测序，获得的数据可用于遗传分化等研究。

数据集引用情况